RNA–단백질 상호작용 연구를 위한 Uvitec CL-508 UV Crosslinker
RNA-binding protein(RBP)은 RNA splicing, 안정성, 번역 조절 등, 전사 후 조절(Post-transcriptional regulation)의 핵심적인 역할을 담당합니다.
이러한 단백질의 기능을 이해하기 위해서는 RNA와 단백질이 실제로 결합하는 지점을 정확히 포착하는 것이 무엇보다 중요합니다.
이때 널리 사용되는 방법이 바로 CLIP (Crosslinking and Immunoprecipitation) 입니다.
CLIP 연구에서 UV Crosslinking이 중요한 이유
CLIP은 자외선(UV)을 이용해 RNA와 단백질을 세포 내 상태 그대로 공유결합(crosslinking) 시킨 뒤, 면역침전과 시퀀싱을 통해 RNA–단백질 상호작용 부위를 분석하는 기술입니다.
이 과정에서 UV 조사 조건은
•crosslink 효율
•비특이적 결합(background)
•최종 시퀀싱 데이터 품질
에 직접적인 영향을 미치기 때문에, 정확하고 재현성 있는 UV 조사 장비 선택이 CLIP 실험의 성패를 좌우합니다.
Uvitec CL-508 UV Crosslinker 소개
Uvitec CL-508은 RNA–단백질 crosslinking과 같은 정밀 UV 기반 실험을 위해 설계된 UV Crosslinker입니다.
CLIP, iCLIP, eCLIP 실험에서 요구되는 안정적인 UV 에너지 제어와 반복 재현성을 제공합니다.
주요 특징
•UV 조사량을 에너지(J/cm²) 또는 시간(sec) 기준으로 정밀 설정
•내장 UV 센서를 통한 조사량 모니터링
•반복 실험 간 조사 조건 편차 최소화
•직관적인 디스플레이와 안전 인터록 도어 설계
CLIP 연구에 최적화된 254 nm UV 조사
표준 CLIP, iCLIP, eCLIP 프로토콜에서는 254 nm (UVC) 파장을 이용해 RNA와 단백질 간의 직접적인 공유결합을 유도합니다.
CL-508은 254 nm UV 램프 사용을 통해
•비가역적 RNA–단백질 crosslink 형성
•낮은 background
•신뢰도 높은 결합 부위 분석
을 가능하게 하여, 고품질 CLIP-seq 데이터 확보를 지원합니다.
PAR-CLIP까지 고려한 파장 선택 유연성
CL-508은 실험 목적에 따라 서로 다른 파장 활용이 가능합니다.
254 nm (UVC): 표준 CLIP / iCLIP / eCLIP에 사용
365 nm (UVA): 4-thiouridine(4SU), 6SG 등 광활성 뉴클레오사이드를 사용하는 PAR-CLIP 실험에 활용
※ 일반적인 CLIP 실험의 핵심 파장은 254 nm이며, 365 nm는 PAR-CLIP과 같은 특수 프로토콜에 해당합니다.
이런 연구자에게 추천합니다
•RNA-binding protein(RBP) 기능을 연구하는 연구자
•RNA splicing, stability, translation 조절 연구자
•CLIP-seq / iCLIP / eCLIP / PAR-CLIP 실험을 수행하는 연구실
•UV crosslinking 기반 고정밀 분자생물학 실험 환경을 구축하려는 연구자
마무리하며
CLIP 실험에서 정확한 UV Crosslinking은 선택이 아닌 필수입니다.
Uvitec CL-508 UV Crosslinker는 RNA–단백질 상호작용 연구에 필요한 정밀성, 재현성, 실험 편의성을 모두 고려한 장비입니다.
CLIP 연구의 시작, UV Crosslinking부터 다르게 준비해 보세요.
