Lab Services
Microbial Identification
서비스 소개
미생물 동정 서비스는 원핵세포 미생물 (세균, Bacteria)과 진핵세포 미생물 (진균, Fungi/Yeast)의 ribosomal RNA 서열을 분석한 후 GeneBank의 서열 정보와 유사성을 비교하여 미생물 종을 판별하여 제공하는 서비스입니다.
세균동정 (Bacteria)
Microbial Identification primer: Bacteria
| Target region | Primer | Sequence |
| 16s rRNA | 27F | AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG |
| 337F | GAC TCC TAC GGG AGG CWG CAG | |
| 518F | CCA GCA GCC GCG GTA ATA CG | |
| 785F | GGA TTA GAT ACC CTG GTA | |
| 1100F | YAA CGA GCG CAA CCC | |
| 518R | ATT ACC GCG GCT GCT GG | |
| 800R | TAC CAG GGT ATC TAA TCC | |
| 907R | CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT | |
| 1100R | GGG TTG CGC TCG TTG | |
| 1492R | GGT TAC CTT GTT ACG ACT TC | |
| 23s rRNA | 1f | TCC GAA TGG GGA AAC CC |
| 16r | GGA ACT TAC CCG ACA AGG | |
| 9f | AAG AGG GAA ACA RCC CAG A | |
| 23r | TTC GTG CTT AGA TGC YTT CA |
진균동정 (Fungi/Yeast)
Microbial Identification primer: Fungi / Yeast
| Target region | Primer | Sequence |
| 5.8s rRNA(ITS) | ITS1 | TCC GTA GGT GAA CCT GCG G |
| ITS4 | TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC | |
| 18s rRNA | NS1 | GTA GTC ATA TGC TTG TCT C |
| NS8 | TCC GCA GGT TCA CCT AC GGA | |
| 25~28s rRNA (D1/D2 domain) |
NL1 | GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG |
| NL4 | GGT CCG TGT TTC AAG ACG G | |
| 25~28s rRNA (D1/D2/D3 domain) |
LROR | ACC CGC TGA ACT TAA GC |
| LR7 | TAC TAC CAC CAA GAT CT |
뷴류 미상 (Unknown)
•미생물에 대한 기본정보 없는 경우에 해당합니다.
•여러 종류의 primer set을 이용하여 PCR을 진행한 후 염기서열을 확인하여 드립니다.
•분석 부위: 16s, 5.8s, 18s, 25~28s(D1/D2 domain)
Sample type
• Cell (plate or tube) 또는 Genomic DNA
• 병원성 균주의 경우: 사멸화 균체 또는 gDNA
분석절차
1. Sample 배송 및 접수
-영업사원 전달, 택배 이용
-냉장 배송 권장
2. 접수 및 시료 검수
– 필요시 gDNA prep.
– Template DNA QC
3. PCR 진행
-16S/18S/26S rRNA & ITS Region
4. Sequencing
-Applied biosystems 3730XL DNA analyzer
-BigDye Terminator version 3.1 kit
5. 결과분석 및 발송
-결과 data 형식: pdf, ab1, seq 파일
-요청시 align/blast 별도 진행
-보관 기간: 샘플-1주일 (별도 요청시 한달) / 결과데이터-6개월)
서비스 신청 방법
아래 주문서를 작성하여 oligo@biod.co.kr 로 송부 후, 샘플 수거 상담 및 택배 발송하시면 됩니다.
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