Microsatellites (SSR, STR)란?
우리의 DNA에는 짧은 염기서열이 여러 번 반복되어 있는 구간이 있습니다.
이러한 반복 서열을 SSR(Simple Sequence Repeat) 혹은 STR(Short Tandem Repeat)이라고 부릅니다.
예를 들어, “AT”라는 염기가 10번 반복된 “ATATAT…” 같은 구간이 하나의 SSR입니다.
이 반복 횟수는 개인이나 개체마다 다르기 때문에, 유전적 지문(fingerprint) 역할을 할 수 있습니다.
그래서 SSR/STR 분석은 다음과 같은 다양한 분야에서 널리 활용됩니다.
🔹 생물 종 동정: 유사한 종을 구별
🔹 개체군 유전학 연구: 유전적 다양성과 개체 간 관계 분석
🔹 법의학 / 친자확인: STR 패턴을 이용한 개인식별
🔹 질병 연구: 반복서열 이상으로 인한 유전질환(예: 헌팅턴병) 분석
그런데, SSR 분석은 왜 까다로울까요?
SSR은 단 몇 개의 염기 차이로 변이가 생기기 때문에, 이를 정확히 구분하려면 정밀한 분리능과 재현성이 필요합니다.
하지만 전통적인 젤 전기영동 방법은
밴드 간 구분이 모호하고,
시료 처리와 해석이 수동적이며,
결과 재현성이 낮다는 단점이 있습니다.
반면, NGS(차세대 염기서열분석)는 정확하긴 하지만 장비와 시료 처리 비용이 높아 일상적인 실험에 적용하기 어려운 현실이죠.
그래서 필요한 솔루션, BiOptic Qsep 시리즈
BiOptic Qsep 시리즈는 모세관 전기영동(Capillary Electrophoresis, CE) 기술을 기반으로 한
자동화 DNA/RNA 분석 플랫폼입니다. 이 기술은 분리 효율성이 매우 높아 복잡한 시료를 빠르고 정밀하게 분석할 수 있습니다.
Qsep 시리즈의 주요 특징
| 특징 | 설명 |
| 🎯고정밀 분리능 | 1 bp 단위의 반복 차이도 감지 가능 |
| 🤖자동화 시스템 | 시료 주입부터 결과 분석까지 원클릭 |
| 💧소량 시료 사용 | PCR 산물만 있으면 바로 분석 가능 |
| 💰경제성 | NGS 대비 훨씬 낮은 시료·운영비 |
| 🧩다양한 카트리지 지원 | SSR, RNA, 플라스미드 등 다양한 용도 적용 |
실제 적용 사례
BiOptic의 공식 예시 중 하나는 Qsep S1 장비를 활용한 Torreya grandis (비자나무의 일종) 3개 계통 분석입니다.
SSR 마커를 적용한 결과, 각 계통이 서로 다른 피크 패턴으로 명확히 구분되었고, 이로써 Qsep의 정밀한 반복서열 검출 능력이 입증되었습니다.

또한, Qsep은 바이러스 병원체 분석이나 종양세포의 마이크로새틀라이트 불안정성(MSI) 검사 등에도 활용되고 있습니다.

기존 방식 Vs. Qsep 시리즈
| 항목 | 기존 젤 전기영동 | Qsep 시리즈 |
| 준비 과정 | 젤 제작·염색 필요 | 카트리지 자동 시스템 |
| 분석 시간 | 수십 분~1시간 | 약 5~15분 |
| 데이터 해석 | 밴드 시각 판독 | 소프트웨어 자동 분석 |
| 정밀도 | ± 몇 bp 수준 | 1 bp 단위 정밀 구분 |
| 재현성 | 낮음 | 매우 높음 |
결과적으로, Qsep은 SSR 분석의 효율성과 정확성을 모두 잡은 솔루션입니다.
PCR만 완료되면, 나머지는 Qsep이 알아서 처리해 줍니다.
Qsep이 빛나는 연구 분야
🔹유전학 연구소 – 개체군 다양성 및 유전자 변이 분석
🔹농업/식물육종 연구 – 품종 동정, 교배 모니터링
🔹의학·병리학 연구 – MSI 기반 암 진단 보조
🔹법의학·식별 분석 – STR 패턴을 이용한 개인식별
반복서열 연구, 이제 Qsep으로 간편하게!
SSR/STR 분석은 복잡해 보이지만, BiOptic Qsep 시리즈를 사용하면 누구나 정확하고 재현성 높은 결과를 손쉽게 얻을 수 있습니다.
반복서열 연구, 이제 Qsep 시리즈로 간편하게 시작해보세요.
https://www.biod.co.kr/?s=QSEP
| Qsep1 | Qsep1 Plus | Qsep100 | Qsep400 | |
| System Type | 1 Channel Portable System | 1 Channel Portable System | 1 Channel Standard System | 4-Channel System |
| Automated Sampling | 1~8 samples | 1~16 samples | 1~96 samples | 1~96 samples |
| Rapid Analysis | 2~7 min/sample | 2~7 min/sample | 2~7 min/sample | 2~7 min/4 samples |
| Weight | 5.5Kg | 5.5Kg | 15Kg | 26Kg |
| Dimension | 24(L)×21(W)×30(H) | 24(L)×21(W)×30(H) | 38(L)×30(W)×40(H) | 54(L)×40(W)×36(H) |



