Lab Services

Microbial Identification

서비스 소개

미생물 동정 서비스는 원핵세포 미생물 (세균, Bacteria)과 진핵세포 미생물 (진균, Fungi/Yeast)의 ribosomal RNA 서열을 분석한 후 GeneBank의 셔열 정보와 유사성을 비교하여 미생물 종을 알아내는 서비스입니다.

세균동정 (Bacteria)


Microbial Identification primer: Bacteria

Target region Primer Sequence
16s rRNA 27F AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG
337F GAC TCC TAC GGG AGG CWG CAG
518F CCA GCA GCC GCG GTA ATA CG
785F GGA TTA GAT ACC CTG GTA
1100F YAA CGA GCG CAA CCC
518R ATT ACC GCG GCT GCT GG
800R TAC CAG GGT ATC TAA TCC
907R CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT
1100R GGG TTG CGC TCG TTG
1492R GGT TAC CTT GTT ACG ACT TC
23s rRNA 1f TCC GAA TGG GGA AAC CC
16r GGA ACT TAC CCG ACA AGG
9f AAG AGG GAA ACA RCC CAG A
23r TTC GTG CTT AGA TGC YTT CA

진균동정 (Fungi/Yeast)


Microbial Identification primer:
Fungi / Yeast

Target region Primer Sequence
5.8s rRNA(ITS) ITS1 TCC GTA GGT GAA CCT GCG G
ITS4 TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC
18s rRNA NS1 GTA GTC ATA TGC TTG TCT C
NS8 TCC GCA GGT TCA CCT AC GGA
25~28s rRNA
(D1/D2 domain)
NL1 GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG
NL4 GGT CCG TGT TTC AAG ACG G
25~28s rRNA
(D1/D2/D3 domain)
LROR ACC CGC TGA ACT TAA GC
LR7 TAC TAC CAC CAA GAT CT

뷴류 미상 (Unknown)

•미생물에 대한 기본정보 없는 경우에 해당합니다.
•여러 종류의 primer set을 이용하여 PCR을 진행한 후 염기서열을 확인하여 드립니다.
•분석 부위: 16s, 5.8s, 18s, 25~28s(D1/D2 domain)

Sample type

• Cell (plate or tube) 또는 Genomic DNA
• 병원성 균주의 경우: 사멸화 균체 또는 gDNA

분석절차

1. Sample 배송 및 접수

-영업사원 전달, 택배 이용
-냉장 배송 권장

2. 접수 및 시료 검수
– 필요시 gDNA prep.
– Template DNA QC

3. PCR 진행
-16S/18S/26S rRNA & ITS Region

4. Sequencing 
-Applied biosystems 3730XL DNA analyzer
-BigDye Terminator version 3.1 kit

5. 결과분석 및 발송

-결과 data 형식: pdf, ab1, seq 파일

-요청시 align/blast 별도 진행
-보관 기간: 샘플-1주일 (별도 요청시 한달) / 결과데이터-6개월)

서비스 신청 방법

아래 주문서를 작성하여 oligo@bio-d.co.kr 로 송부 후, 샘플 수거 상담 및 택배 발송하시면 됩니다.