Lab Services

DNA/RNA Sequencing

서비스 소개

High throughput DNA Analyzer를 이용하여 빠르고 정확한 시퀀싱 서비스를 제공합니다.

-샘플 접수 후 24시간 이내 1차 결과 발송
-다양한 universal primer 무료 제공
-Primer 합성 서비스와 연계 가능
-PCR purification, Gel extraction, Plasmid prep 등 연계 서비스 제공

Sample 및 Primer 조건

Sample type:
Purified PCR product(A): 적정 농도 50~100ng/ul, 최소 vol. 15ul
non-purified PCR product(B): 적정 농도 100ng/ul 이상 , 최소 vol. 20ul
Plasmid(C): 적정 농도 150~200ng/ul , 최소 vol. 15ul

Primer 농도:
10pmol/uL , 1 반응당 1uL 소모, (Tm : 55~60℃, GC content : 40~60%)
예) sample 10개, primer 2개일 경우 = 20반응, 20ul 필요.

Universal Primer list

※ 제공되는 정보는 참고용이므로 반드시 sequence 일치 여부를 확인한 후 의뢰하여 주십시오.

Vector primer

Primer Sequence Primer Sequence
T7 TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG MATCHMAKER5 GAA GAT ACC CCA CCA AAC
T7terminator GCT AGT TAT TGC TCA GCG G MATCHMAKER3 GTG AAC TTG CGG GGT TTT TCA GTA TCT ACG AT
T3 ATT AAC CCT CAC TAA AG GAL4(-BD)-3 TTT TCG TTT TAA AAC CTA AGA GT
SP6 ATT TAG GTG ACA CTA TAG GAL4(-BD)-5 TCA TCG GAA GAG AGT AGT
BGH-R CTA GAA GGC ACA GTC GAG GC pJET1.2-F CGA CTC ACT ATA GGG AGA GCG GC
M13F(-40) GTT TTC CCA GTC ACG AC pJET1.2-R AAG AAC ATC GAT TTT CCA TGG CAG
M13R(-40) CAG GAA ACA GCT ATG AC pET-upstream ATG CGT CCG GCG TAG AGG
M13F(-20) GTA AAA CGA CGG CCA GT DuetUP2 TTG TAC ACG GCC GCA TAA TC
M13R(-20) GCG GAT AAC AAT TTC ACA CAG DuetDown1 GAT TAT GCG GCC GTG TAC AA
pGEX5 GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG ACYCDuetUP1 GGA TCT CGA CGC TCT CCC T
pGEX3 CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG pFB-F GGA TTA TTC ATA CCG TCC CA
CMV-F CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTG pFB-R CAA ATG TGG TAT GGC TGA TT
CMV30 AAT GTC GTA ATA ACC CCG CCC CGT TGA CGC pMAL-F AAC ATC CCG CAG ATG TCC
CMV24 TAT TAG GAC AAG GCT GGT GGG CAC pMAL-R CAA GCT GCC ATT CGC CAT
EGFP-C CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G pBad-F ATG CCA TAG CAT TTT TAT CC
EGFP-N CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G pBad-R GAT TTA ATC TGT ATC AGG
SV40 pAR GAA ATT TGT GAT GCT ATT GC pQE-forward CCC GAA AAG TGC CAC CTG
RV3 CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC pQE-reverse GTT CTG AGG TCA TTA CTG G
RV4 GAC GAT AGT CAT GCC CCG CG U6(FLAP) CAG TGC AGG GGA AAG AAT AGT AGA C
GL1 TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG U6pro GGG CAG GAA GAG GGC CTA T
GL2 CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA EBV-R GTG GTT TGT CCA AAC TCA TC
mCherry-N GTG GCC GTT CAC GGA GCC IRES-F CTG AAG GAT GCC CAG AAG
mCherry-C CGC CTA CAA CGT CAA CAT CA IRES-R GAC GGC AAT ATG GTG GAA
96gIII CCC TCA TAG TTA GCG TAA CG

Universal Primer list

Microbial Identification primer: Bacteria

Target region Primer Sequence
16s rRNA 27F AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG
337F GAC TCC TAC GGG AGG CWG CAG
518F CCA GCA GCC GCG GTA ATA CG
785F GGA TTA GAT ACC CTG GTA
1100F YAA CGA GCG CAA CCC
518R ATT ACC GCG GCT GCT GG
800R TAC CAG GGT ATC TAA TCC
907R CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT
1100R GGG TTG CGC TCG TTG
1492R GGT TAC CTT GTT ACG ACT TC
23s rRNA 1f TCC GAA TGG GGA AAC CC
16r GGA ACT TAC CCG ACA AGG
9f AAG AGG GAA ACA RCC CAG A
23r TTC GTG CTT AGA TGC YTT CA

Universal Primer list

Microbial Identification primer: Fungi / Yeast

Target region Primer Sequence
5.8s rRNA(ITS) ITS1 TCC GTA GGT GAA CCT GCG G
ITS4 TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC
18s rRNA NS1 GTA GTC ATA TGC TTG TCT C
NS8 TCC GCA GGT TCA CCT AC GGA
25~28s rRNA
(D1/D2 domain)		 NL1 GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG
NL4 GGT CCG TGT TTC AAG ACG G
25~28s rRNA
(D1/D2/D3 domain)		 LROR ACC CGC TGA ACT TAA GC
LR7 TAC TAC CAC CAA GAT CT

분석절차

1. Sample 및 primer 수거

-영업사원 전달, 택배 이용
-냉장 또는 냉동 배송 권장
-필요시 Primer 별도 제작

2. 접수 및 시료 검수

-Agarose gel 전기영동으로 template DNA QC

3. Sequencing 진행

-Applied biosystems 3730XL DNA analyzer
-BigDye Terminator version 3.1 kit

4. 결과분석 및 발송

-이메일로 24시간 이내 결과 발송
-결과 data 형식: pdf, ab1, seq 파일
-보관 기간: 샘플 1주일 (별도 요청시 한달) / 결과데이터: 6개월)

서비스 신청 방법

아래 주문서를 작성하여 oligo@bio-d.co.kr 로 송부 후, 샘플 수거 상담 및 택배 발송하시면 됩니다.

BioD_Sequencing_Order_sheet