Lab Services
DNA/RNA Sequencing
서비스 소개
High throughput DNA Analyzer를 이용하여 빠르고 정확한 시퀀싱 서비스를 제공합니다.
-샘플 접수 후 24시간 이내 1차 결과 발송
-다양한 universal primer 무료 제공
-Primer 합성 서비스와 연계 가능
-PCR purification, Gel extraction, Plasmid prep 등 연계 서비스 제공
Sample 및 Primer 조건
Sample type:
Purified PCR product(A): 적정 농도 50~100ng/ul, 최소 vol. 15ul
non-purified PCR product(B): 적정 농도 100ng/ul 이상 , 최소 vol. 20ul
Plasmid(C): 적정 농도 150~200ng/ul , 최소 vol. 15ul
Primer 농도:
10pmol/uL , 1 반응당 1uL 소모, (Tm : 55~60℃, GC content : 40~60%)
예) sample 10개, primer 2개일 경우 = 20반응, 20ul 필요.
Universal Primer list
※ 제공되는 정보는 참고용이므로 반드시 sequence 일치 여부를 확인한 후 의뢰하여 주십시오.
Vector primer
Primer | Sequence | Primer | Sequence |
T7 | TAA TAC GAC TCA CTA TAG GG | MATCHMAKER5 | GAA GAT ACC CCA CCA AAC |
T7terminator | GCT AGT TAT TGC TCA GCG G | MATCHMAKER3 | GTG AAC TTG CGG GGT TTT TCA GTA TCT ACG AT |
T3 | ATT AAC CCT CAC TAA AG | GAL4(-BD)-3 | TTT TCG TTT TAA AAC CTA AGA GT |
SP6 | ATT TAG GTG ACA CTA TAG | GAL4(-BD)-5 | TCA TCG GAA GAG AGT AGT |
BGH-R | CTA GAA GGC ACA GTC GAG GC | pJET1.2-F | CGA CTC ACT ATA GGG AGA GCG GC |
M13F(-40) | GTT TTC CCA GTC ACG AC | pJET1.2-R | AAG AAC ATC GAT TTT CCA TGG CAG |
M13R(-40) | CAG GAA ACA GCT ATG AC | pET-upstream | ATG CGT CCG GCG TAG AGG |
M13F(-20) | GTA AAA CGA CGG CCA GT | DuetUP2 | TTG TAC ACG GCC GCA TAA TC |
M13R(-20) | GCG GAT AAC AAT TTC ACA CAG | DuetDown1 | GAT TAT GCG GCC GTG TAC AA |
pGEX5 | GGG CTG GCA AGC CAC GTT TGG TG | ACYCDuetUP1 | GGA TCT CGA CGC TCT CCC T |
pGEX3 | CCG GGA GCT GCA TGT GTC AGA GG | pFB-F | GGA TTA TTC ATA CCG TCC CA |
CMV-F | CGC AAA TGG GCG GTA GGC GTG | pFB-R | CAA ATG TGG TAT GGC TGA TT |
CMV30 | AAT GTC GTA ATA ACC CCG CCC CGT TGA CGC | pMAL-F | AAC ATC CCG CAG ATG TCC |
CMV24 | TAT TAG GAC AAG GCT GGT GGG CAC | pMAL-R | CAA GCT GCC ATT CGC CAT |
EGFP-C | CAT GGT CCT GCT GGA GTT CGT G | pBad-F | ATG CCA TAG CAT TTT TAT CC |
EGFP-N | CGT CGC CGT CCA GCT CGA CCA G | pBad-R | GAT TTA ATC TGT ATC AGG |
SV40 pAR | GAA ATT TGT GAT GCT ATT GC | pQE-forward | CCC GAA AAG TGC CAC CTG |
RV3 | CTA GCA AAA TAG GCT GTC CC | pQE-reverse | GTT CTG AGG TCA TTA CTG G |
RV4 | GAC GAT AGT CAT GCC CCG CG | U6(FLAP) | CAG TGC AGG GGA AAG AAT AGT AGA C |
GL1 | TGT ATC TTA TGG TAC TGT AAC TG | U6pro | GGG CAG GAA GAG GGC CTA T |
GL2 | CTT TAT GTT TTT GGC GTC TTC CA | EBV-R | GTG GTT TGT CCA AAC TCA TC |
mCherry-N | GTG GCC GTT CAC GGA GCC | IRES-F | CTG AAG GAT GCC CAG AAG |
mCherry-C | CGC CTA CAA CGT CAA CAT CA | IRES-R | GAC GGC AAT ATG GTG GAA |
96gIII | CCC TCA TAG TTA GCG TAA CG |
Universal Primer list
Microbial Identification primer: Bacteria
Target region | Primer | Sequence |
16s rRNA | 27F | AGA GTT TGA TCM TGG CTC AG |
337F | GAC TCC TAC GGG AGG CWG CAG | |
518F | CCA GCA GCC GCG GTA ATA CG | |
785F | GGA TTA GAT ACC CTG GTA | |
1100F | YAA CGA GCG CAA CCC | |
518R | ATT ACC GCG GCT GCT GG | |
800R | TAC CAG GGT ATC TAA TCC | |
907R | CCG TCA ATT CMT TTR AGT TT | |
1100R | GGG TTG CGC TCG TTG | |
1492R | GGT TAC CTT GTT ACG ACT TC | |
23s rRNA | 1f | TCC GAA TGG GGA AAC CC |
16r | GGA ACT TAC CCG ACA AGG | |
9f | AAG AGG GAA ACA RCC CAG A | |
23r | TTC GTG CTT AGA TGC YTT CA |
Universal Primer list
Microbial Identification primer: Fungi / Yeast
Target region | Primer | Sequence |
5.8s rRNA(ITS) | ITS1 | TCC GTA GGT GAA CCT GCG G |
ITS4 | TCC TCC GCT TAT TGA TAT GC | |
18s rRNA | NS1 | GTA GTC ATA TGC TTG TCT C |
NS8 | TCC GCA GGT TCA CCT AC GGA | |
25~28s rRNA (D1/D2 domain) |
NL1 | GCA TAT CAA TAA GCG GAG GAA AAG |
NL4 | GGT CCG TGT TTC AAG ACG G | |
25~28s rRNA (D1/D2/D3 domain) |
LROR | ACC CGC TGA ACT TAA GC |
LR7 | TAC TAC CAC CAA GAT CT |
분석절차
1. Sample 및 primer 수거
-영업사원 전달, 택배 이용
-냉장 또는 냉동 배송 권장
-필요시 Primer 별도 제작
2. 접수 및 시료 검수
-Agarose gel 전기영동으로 template DNA QC
3. Sequencing 진행
-Applied biosystems 3730XL DNA analyzer
-BigDye Terminator version 3.1 kit
4. 결과분석 및 발송
-이메일로 24시간 이내 결과 발송
-결과 data 형식: pdf, ab1, seq 파일
-보관 기간: 샘플 1주일 (별도 요청시 한달) / 결과데이터: 6개월)
서비스 신청 방법
아래 주문서를 작성하여 oligo@bio-d.co.kr 로 송부 후, 샘플 수거 상담 및 택배 발송하시면 됩니다.